С 1 декабря 1991 года Госстрой СССР был ликвидирован, а все подведомственные ему предприятия, организации и учреждения, находившиеся на территории РСФСР, в том числе и библиотека, были переданы Министерству архитектуры, строительства и жилищно-коммунального хозяйства РСФСР.
С 2013 года федеральное бюджетное учреждение «Центральная научно-техническая библиотека по строительству и архитектуре» являлось подведомственной организацией Министерства строительства и жилищно-коммунального хозяйства Российской Федерации (Минстрой России).
В 2019 году ЦНТБ СиА стала структурным подразделением федерального бюджетного учреждения «Федеральный центр строительного контроля».
Сегодня библиотекой взят курс на обновление и возрождение, раскрытие фондов для специалистов и любителей. Несмотря на переходные и кризисные периоды новейшей истории, благодаря работе сотрудников – хранителей, библиографов, библиотекарей, накопленные почти за столетие библиотечные фонды были сохранены и продолжают пополняться новыми изданиями по профильным отраслям знаний.